Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pus3Q9JI38 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pus3Q9JI38 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pus3Q9JI38 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms