Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trappc4Q9ES56 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Trappc4Q9ES56 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Trappc4Q9ES56 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms