Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hipk3Q9ERH7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hipk3Q9ERH7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms