Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE8

Tlnrd1, Talin rod domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlnrd1Q9ERE8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tlnrd1Q9ERE8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tlnrd1Q9ERE8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms