Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sall1Q9ER74 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sall1Q9ER74 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sall1Q9ER74 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms