Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Clstn2Q9ER65 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Clstn2Q9ER65 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Clstn2Q9ER65 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms