Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Col4a3bpQ9EQG9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Col4a3bpQ9EQG9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms