Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ51

Vmn1r47, Vomeronasal type-1 receptor 47, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r47Q9EQ51 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r47Q9EQ51 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r47Q9EQ51 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms