Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Rpgrip1Q9EPQ2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Rpgrip1Q9EPQ2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms