Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clstn1Q9EPL2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clstn1Q9EPL2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms