Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Sdf2Q9DCT5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sdf2Q9DCT5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms