Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rnft1Q9DCN7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rnft1Q9DCN7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms