Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cbx6Q9DBY5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cbx6Q9DBY5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms