Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBX3

Susd2, Sushi domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd2Q9DBX3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Susd2Q9DBX3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Susd2Q9DBX3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Susd2Q9DBX3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Susd2Q9DBX3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Susd2Q9DBX3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Susd2Q9DBX3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Susd2Q9DBX3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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