Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Riok3Q9DBU3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Riok3Q9DBU3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms