Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBS1

Tmem43, Transmembrane protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem43Q9DBS1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem43Q9DBS1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem43Q9DBS1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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