Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ap1s2Q9DB50 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ap1s2Q9DB50 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms