Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pop5Q9DB28 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pop5Q9DB28 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pop5Q9DB28 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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