Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAG9

Phf7, PHD finger protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf7Q9DAG9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf7Q9DAG9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf7Q9DAG9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Phf7Q9DAG9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Phf7Q9DAG9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf7Q9DAG9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf7Q9DAG9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf7Q9DAG9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf7Q9DAG9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf7Q9DAG9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf7Q9DAG9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf7Q9DAG9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf7Q9DAG9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms