Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pdzd9Q9D9M4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pdzd9Q9D9M4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pdzd9Q9D9M4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms