Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp12Q9D9M2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Usp12Q9D9M2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp12Q9D9M2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp12Q9D9M2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp12Q9D9M2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp12Q9D9M2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Usp12Q9D9M2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Usp12Q9D9M2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Usp12Q9D9M2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Usp12Q9D9M2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Usp12Q9D9M2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Usp12Q9D9M2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usp12Q9D9M2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
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