Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Snx5Q9D8U8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Snx5Q9D8U8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms