Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
U2af1Q9D883 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
U2af1Q9D883 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
U2af1Q9D883 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms