Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Capn9Q9D805 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Capn9Q9D805 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Capn9Q9D805 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms