Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V2

Lysmd2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd2Q9D7V2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lysmd2Q9D7V2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lysmd2Q9D7V2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lysmd2Q9D7V2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lysmd2Q9D7V2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lysmd2Q9D7V2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lysmd2Q9D7V2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lysmd2Q9D7V2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lysmd2Q9D7V2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lysmd2Q9D7V2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lysmd2Q9D7V2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lysmd2Q9D7V2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lysmd2Q9D7V2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lysmd2Q9D7V2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms