Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chmp5Q9D7S9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp5Q9D7S9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp5Q9D7S9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms