Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl40Q9D783 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Klhl40Q9D783 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms