Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tube1Q9D6T1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tube1Q9D6T1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms