Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc94Q9D6J3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc94Q9D6J3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc94Q9D6J3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms