Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ShpkQ9D5J6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ShpkQ9D5J6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms