Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox2aQ9D4Y3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox2aQ9D4Y3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox2aQ9D4Y3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox2aQ9D4Y3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox2aQ9D4Y3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox2aQ9D4Y3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox2aQ9D4Y3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox2aQ9D4Y3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox2aQ9D4Y3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox2aQ9D4Y3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox2aQ9D4Y3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox2aQ9D4Y3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox2aQ9D4Y3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rhox2aQ9D4Y3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rhox2aQ9D4Y3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rhox2aQ9D4Y3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox2aQ9D4Y3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox2aQ9D4Y3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox2aQ9D4Y3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox2aQ9D4Y3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rhox2aQ9D4Y3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms