Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tubgcp4Q9D4F8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tubgcp4Q9D4F8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tubgcp4Q9D4F8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms