Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trmt44Q9D2Q2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trmt44Q9D2Q2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trmt44Q9D2Q2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms