Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klhdc8bQ9D2D9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Klhdc8bQ9D2D9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms