Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nol3Q9D1X0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nol3Q9D1X0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms