Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D6

Cthrc1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cthrc1Q9D1D6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cthrc1Q9D1D6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cthrc1Q9D1D6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms