Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Syf2Q9D198 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Syf2Q9D198 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms