Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem53Q9D0Z3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem53Q9D0Z3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms