Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab3bQ9CZT8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab3bQ9CZT8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.9 ms