Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ssu72Q9CY97 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ssu72Q9CY97 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms