Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Exo5Q9CXP9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Exo5Q9CXP9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms