Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Prdm5Q9CXE0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Prdm5Q9CXE0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Prdm5Q9CXE0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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