Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Malsu1Q9CWV0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Malsu1Q9CWV0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Malsu1Q9CWV0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Malsu1Q9CWV0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Malsu1Q9CWV0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Malsu1Q9CWV0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Malsu1Q9CWV0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Malsu1Q9CWV0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Malsu1Q9CWV0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Malsu1Q9CWV0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms