Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Snx10Q9CWT3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Snx10Q9CWT3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms