Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NubplQ9CWD8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NubplQ9CWD8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms