Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atxn3Q9CVD2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Atxn3Q9CVD2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atxn3Q9CVD2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms