Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp13a2Q9CTG6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp13a2Q9CTG6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Atp13a2Q9CTG6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Atp13a2Q9CTG6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp13a2Q9CTG6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms