Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3kQ9CQZ7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3kQ9CQZ7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3kQ9CQZ7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3kQ9CQZ7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3kQ9CQZ7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3kQ9CQZ7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3kQ9CQZ7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3kQ9CQZ7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3kQ9CQZ7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3kQ9CQZ7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Polr3kQ9CQZ7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Polr3kQ9CQZ7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms