Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atg12Q9CQY1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms