Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PompQ9CQT5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PompQ9CQT5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms